Trečias kiemas
Pakabinti Felicity vartai veda į trečiąjį kiemą arba vidinį kiemą, kuriame buvo sultono privati rezidencija ir vidinė rūmų mokykla. Į ją patekti galėjo tik sultonas, jo šeimos nariai, tarnai ir retkarčiais patvirtintas lankytojas. Sultono lankytojai galėjo nuvykti tik į Auditorijos rūmus ir tikėtasi, kad jie laikysis griežtų papročių. Jie negalėjo susisiekti su akimis ar kalbėti tiesiogiai su sultonu, o nuleido galvas, nuleido akis žemyn ir kalbėjosi su sultono vertėju.
Prieš Muradas III XVI amžiuje persikėlė į savo gyvenamąją vietą hareme, sultono butai buvo trečiajame namo kieme, dažnai vadinamame Šventųjų religijų rūmais. Pavadinimas kilo dėl jo, kaip islamo relikvijų, įskaitant pranašo Muhammedo mantiją, kardą ir lanką, saugyklos, kurios visos buvo gautos, kai Selimas I užkariavo Mamlūkų dinastiją 1517 m. Egipte, perduodamas kalifatą osmanams.
Trečiajame kieme taip pat yra karališkųjų puslapių bendrabučiai, kurie buvo sultono tarnų hierarchijos dalis. Daugelis puslapių buvo verbuojami kaip berniukai iš užkariautų krikščionių gyventojų per devşirme sistemą, kurioje berniukai buvo pašalinti iš savo šeimos kaip mokesčio ar duoklės forma. Gavę naujus vardus ir pavertę islamu, ryškiausiems berniukams buvo paskirti konkretūs vaidmenys ir jie uždirbo griežtą išsilavinimą uždirbdami atlyginimus. Jie laikėsi meritokratijos ir galėjo užimti tokias aukštas pareigas kaip didžioji vizija, tačiau daugelis vyrų buvo išlaisvinti sulaukę 25-erių ir vedę haremo mergaitę ar sultono dukrą. Karališkųjų puslapių bendrabučiuose dabar yra imperijos kolekcijų dalys. Pavyzdžiui, sultonų portretai yra Privilegijų rūmų bendrabutyje, o imperatoriškoji drabužių spinta - Kampanijų bendrabutyje. Daugybė abiejų kolekcijų objektų demonstruoja rūmų amatininkų įgūdžius, taip pat technikos ir mados pokyčius. Pavyzdžiui, per drabužių spinta ir portretų kolekciją žiūrovai gali pastebėti ryškų aprangos pokytį XIX amžiuje, kai Europos karinis drabužis pakeitė sultono kaftaną, o fez - pakeitė turbaną.
Viena garsiausių rūmų kolekcijų yra imperatoriškosios brangenybės, esančios Užkariautojo paviljone, taip pat trečiame kieme. Komplekte yra vadinamasis „Spoonmaker's Diamond“, vienas iš didžiausių pjaustytų deimantų pasaulyje, ir smaragdas „Topkapı Dagger“, intriguojantis 1964 m. Kaparėlių filme „Topkapi“. Kaip kitos muziejaus kolekcijos dalys, papuošalų kolekcija liudija į didelius Osmanų imperijos turtus.
Trečiojo kiemo centrą užima sultono Ahmedo III biblioteka, kuri dailiai dekoruota, kaip ir daugelis rūmų pastatų, dažytomis plytelėmis, vitražais ir langinėmis su perlamutro ir dramblio kaulo intarpais. Knygų kolekcija XX amžiuje buvo sujungta su kitomis rūmų knygomis ir perkelta į Aghos mečetę, kuri yra didžiausia rūmų mečetė ir esanti greta. Į Topkapı rūmų kolekciją įeina reti rankraščiai, iliustruoti tomai ir ankstyvosios Korano formos kopijos, kurias tyrėjai gali apžiūrėti skaitykloje.
Ketvirtasis kiemas
Trečiasis kiemas tęsiasi iki ketvirtojo kiemo, kurį daugiausia sudaro sodai su terasais ir paviljonais. Jame yra sodriai dekoruoti Apipjaustymo rūmai, Bagdado paviljonas ir Jerevano paviljonas. Viena ryškiausių ketvirtojo kiemo konstrukcijų yra nuostabi paauksuota bronzinė Iftar Pergola, kur sultonai greitai sulaužytų, jei Ramadanas nukristų vasarą. Daugelis Osmanų sultonų domėjosi gėlėmis ir sodininkyste, o ketvirtasis kiemo sodas alsuoja tulpėmis, kaip jie būtų buvę Osmanų valdymo laikais.
Haremas
Haremas buvo sultono šeimos gyvenamosios patalpos ir buvo griežtai padalijamas pagal lytį. XVI amžiuje ji taip pat tapo sultono rezidencija, kai Muradas III ten turėjo butus. Kaip ir kiti rūmai, haremas buvo nuolat atnaujinamas ir augo pagal poreikį. Rezultatas yra gana mažas išdėstymas ir daugybė architektūros stilių.
Norėdami įeiti į haremą ar išeiti iš jo, gyventojai turėjo praeiti per asfaltuotą juodųjų eunuchų kiemą į Pagrindinius vartus, dar vadinamus Karališkaisiais vartais. Juodieji eunuchai saugojo haremą ir greičiausiai buvo įsigyti vergų rinkose užkariautose žemėse ir kastruojami prieš brendimą. Kaip ir karališkieji puslapiai, eunuchai gaudavo atlyginimus ir vadovaudavosi meritokratija, tačiau skirtingai nuo puslapių, tik keli eunuchai kada nors buvo išlaisvinti. Šį kiemą juosė jų gyvenamosios patalpos, iždininkų rūmai ir kunigaikščių mokykla.
Praėjus pagrindinius vartus, yra Didžiosios karalienės Motinos grindinys, didžiausias haremo ir pats centrinis kiemas. Karalienės motina buvo valdžios hareme centras. Pasivadinusi valinga sultone, ji buvo vyriausioji konsortija, kurios sūnus pakilo į sostą. Ji taip pat turėjo didelę įtaką sultonei, kuri kiekvieną rytą sustotų jos centre esančiuose apartamentuose, norėdama informuoti apie valstybės reikalus.
Sultono butai buvo sujungti su karalienės motina per baltai marmurinį dvigubą hamamą, turkišką pirtį. Viena hamamo pusė buvo skirta sultonui, kita - haremo moterims. Likusią sultono rezidenciją sudaro sosto salė ir trys priestatų kameros. „Murado III“ kambarys „Privy“ yra seniausias ir geriausiai išlikęs haremo pastatas, kurį suprojektavo vienas garsiausių Osmanų imperijos architektų Sinanas. Erdvės kupolo formos detaliai dekoruotos İznik plytelėmis ir kaligrafija, pasakojančiomis Korano eilutes. Dar vieną miegamąjį kambarį, vadinamą vaisių kambariu, papildė Ahmedas III, ir jis yra nepaprastai apibūdinamas subtiliai lakuotais vaisiais ir gėlėmis.
Sultono sūnūs, dukros, broliai ir seserys taip pat gyveno hareme ir užėmė vieną iš šimto haremo kambarių. Pavyzdžiui, Dvynių paviljonai greičiausiai buvo sultono sūnų gyvenamosios patalpos, prasidedančios XVIII a.
Haremas taip pat turėjo tarnaites moterims, sugulovėms ir sultono vyriausioms konsistorijoms skirtas gyvenamąsias patalpas, o kambarius buvo galima pasiekti prie Pagrindinių vartų esančios sugulovių galerijos. Daugelis šių moterų atėjo kaip dovanos ar pirkdamos iš vergų rinkos, būdamos jaunos mergaitės, ir, kaip ir visos rūmų tarnaitės, laikėsi meritokratijos. Gaudami atlyginimą ir mokymąsi jie atlikdavo tarnybines užduotis, kad taptų žmona vienam iš puslapių arba sultono sugulove. Pasirinkusi sugulovę, jauna moteris galėtų pakilti į gretas ir gauti geresnes patalpas, taigi, jei ji pagimdytų sultoną vaikui. Jei vaikas būtų vyras, pakilęs į sostą, sugulovė užimtų galingiausią haremo, kaip karalienės, motiną. Tačiau dauguma haremo mergaičių buvo išlaisvintos sulaukus 16 ar 17 metų ir po jų vedimo susituokė.
