Prieš tai, kai Kosovas paskelbė nepriklausomybę 2008 m. Vasario 17 d., Jis niekada neturėjo tokio politinio statuso, kuris leido jai vėliavą. Po Antrojo pasaulinio karo Kosovas buvo įtrauktas į socialistinę Jugoslaviją kaip Serbijos Respublikos autonominis regionas (vėliau autonominė provincija). Federalinė vyriausybė leido vėliavas tik kelioms Jugoslavijos sudedamosioms respublikoms. Tačiau etniniams albanams, gyvenantiems Kosove, galiausiai buvo leista plaukioti su Albanijos vėliava.
Dešimtojo dešimtmečio pradžioje išnykus socialistinei Jugoslavijai, Kosovas liko Serbijos dalimi, tačiau separatistų judėjimas provincijoje stiprėjo per visą dešimtmetį. 1998 m. Serbija ėmėsi baudžiamųjų veiksmų prieš separatistus Kosove, kuriam 1999 m. Priešinosi Šiaurės Atlanto sutarties organizacija (NATO). Kosovas buvo pavaldus Jungtinių Tautų administracijai, kuri liko ten po 2008 m. Paskelbto Kosovo nepriklausomybės paskelbimo, kol 2009 m. Iš esmės jį pakeitė Europos Sąjungos (ES) pareigūnai. Serbija ir daugelis kitų šalių priešinosi šiai nepriklausomybės deklaracijai.
Buvo surengtas oficialus konkursas išrinkti Kosovo nacionalinę vėliavą. Daugybė įrašų tiesiogiai ar netiesiogiai buvo paremti Albanijos vėliavos dizainu. Pasirinktas modelis, kuriam įtakos turėjo ES vėliava, aiškiai pasakė, pabrėždamas Kosovą kaip daugiatautę šalį. Nacionalinės teritorijos vėliavos fone ir siluete buvo naudojamos ES vėliavos mėlynos ir geltonos spalvos, o ES vėliavos baltų žvaigždžių ratas buvo lygiagretus Kosovo vėliavos baltų žvaigždžių lanke. Buvo sakoma, kad žvaigždės stovi už šešių vyraujančių šalies etninių grupių (albanų, bosnių, goranų, romų, serbų ir turkų). Tačiau etniniai Albanijos ir Serbijos gyventojai Kosove ir toliau naudojosi savo nacionalinėmis vėliavomis.
