Gelio chromatografija, dar vadinama gelio filtravimu, analitinėje chemijoje, cheminių medžiagų atskyrimo technika, išnaudojant greičio, kuriuo jos praeina per porėtą pusiau kietą medžiagą, skirtumus. Šis metodas yra ypač naudingas fermentams, baltymams, peptidams ir aminorūgštims atskirti viena nuo kitos ir nuo mažos molekulinės masės medžiagų. Mišinio komponentai atskiriami gelio chromatografijos būdu atsižvelgiant į komponentų molekulių dydžių skirtumus. Mažos molekulės yra linkusios difuziškai patekti į porėtų dalelių vidų, kad jų srautas būtų apribotas, tuo tarpu didelės molekulės nesugeba patekti į poras ir yra linkusios netrukdomai tekėti. Taigi didžiausią molekulinę masę turintys komponentai pirmiausia palieka lovą, o paskui iš eilės mažesnės molekulės. Labiausiai paplitusios lovos medžiagos yra poliakrilamidas ir polimeras, paruoštas iš dekstrano ir epichlorohidrino. Sausi polimerai paprastai yra suspenduojami tinkamuose agentuose, kad susidarytų vienalytis pusiau kietas mišinys.