Centrinės Amerikos nepriklausomybė pirmą kartą buvo paskelbta 1821 m. Rugsėjo 15 d., Bet vėliau Meksika sublogavo dvejus metus. Naujai nepriklausomų Jungtinių Centrinės Amerikos provincijų vėliava buvo išleista 1823 m. Rugpjūčio 21 d. Ir buvo sudaryta iš mėlynai baltų-mėlynų juostelių su centre esančiu nacionaliniu herbu. Tuose ginkluose iš esmės buvo tų pačių dizaino elementų, kuriuos šiandien naudoja Nikaragva. Net po to, kai penkios federacijos valstybės narės tapo nepriklausomomis šalimis, Nikaragva ir toliau kėlė senąją vėliavą. Galiausiai, 1854 m., Buvo pasirinktas naujas horizontalus Nikaragvos trispalvis geltonai baltas-raudonas, tačiau jis ilgai neskraidė. Vėliau prasidėjęs pilietinis karas ir Šiaurės Amerikos filmavėjų (karinių nuotykių ieškotojų) įsikišimas sukėlė daugybę vėliavų ir buvo greitai pakeistos.
1908 m. Senoji federacijos vėliava buvo vėl panaudota kaip Nikaragvos nacionalinė vėliava su atitinkamais herbo pakeitimais. Šis pagrindinis dizainas su tolesniais herbo pakeitimais buvo dar kartą patvirtintas 1971 m. Rugpjūčio 27 d. Įstatymu, nors raudonai juodas horizontalus Sandinista judėjimo bicolour de facto buvo antrinė nacionalinė vėliava Sandinista valdymo metais (1979 m.). –90). Ant vėliavos herbo yra lygybės trikampis, laisvės kepuraitė ir penki ugnikalniai tarp dviejų vandenynų, simbolizuojančių penkias originalias Centrinės Amerikos šalis tarp Atlanto ir Ramiojo vandenyno baseinų.
